总公司（含进出口公司）组织机构共11个部门、4个驻外机构、2个全资子公司、1个控股公司、1个参股公司。
    主要业务部门：铁路运力计划调度中心、国内销售部、进出口综合业务部、矿山技术咨询部。
    驻外机构：秦皇岛办事处、天津办事处、准格尔煤焦公司、萨拉齐煤站。
    全资子公司：包头友恒公司、乌海新鑫公司。
    控股子公司：内蒙古鑫辰煤业有限公司
    参股公司：内蒙古正华煤炭科工贸有限公司

    为了更好地适应市场经济发展，合理调整产品结构，形成优势互补的产业链条，做大做强企业。目前，总公司遵照自治区经委（煤炭工业局）关于所属二级企业整体改制的部署和指导意见，根据国有企业改制的有关政策法规，实施整体重组改制。重组改制后形成以产要联接为纽带、产权多元化的投资、经营、利益三统一的投资主体，产、供、销统一的经营主体，集科工贸为一体化经营的大型股份制集团公司。
    改制后的集团公司在2007年将形成年产200万吨煤炭的生产能力，2010年末达到300万吨的生产能力，2015年达到年产500万吨的生产能力。在煤炭销售方面除巩固和保证出口煤炭及上海、江浙地区的电煤市场需求外，积极开辟华北地区、自治区境内电煤市场及精煤市场。
    改制后的集团公司拥有煤炭设计、科研等四项甲级资质、两项乙级资质，可以承担大型煤矿设计及组织项目建设管理的强大的专业化队伍。
    集团公司预计年内重组改制全部完成，公司总经理刘文光同志、党委书记牛玉华同志欢迎区内外客户及同仁光临指导。